Projet et Stage ESSI 2:
Recalage, reconstruction 3D et mesures des glandes sébacées à partir de coupes histologiques.

NOMBRE D'ETUDIANTS : 1
ORGANISME :Galderma en collaboration avec l'I3S
LIEU EFFECTIF DU PROJET : Galderma, Sophia Antipolis
MATERIELS ET LOGICIELS UTILISES : PC sous Windows
PREREQUIS : Traitement d'images, Programmation C++
DESCRIPTIF :

Galderma est une filiale de l'Oréal et de Nestlé spécialisée dans la fabrication et la commercialisation de médicaments pour le traitement des maladies de la peau telles que l'acné et le psoriasis. Galderma compte une trentaine de filiales situées dans les principaux pays des cinq continents.
Galderma R et D, une société d'environ 350 personnes, située sur le site de Sophia Antipolis, est le principal centre de Recherche et de Développement de Galderma. Les activités de Galderma R et D visent la découverte et le développement de médicaments innovants pour le traitement des maladies de la peau.

Dans le cadre d'une collaboration avec l'I3S, deux sujets de -stage sont proposés.

Ce second projet concerne des coupes histologiques de glandes sébacées. Dans un premier temps, on effectuera une segmentation automatique de ces glandes pour pouvoir evaluer leur taille. Il conviendra également d'étudier différents algorithmes de segmentation et de les comparer. Ensuite, on cherchera à reconstruire ces glandes en 3D à partir des coupes 2D pour evaluer leur volume. Ceci nécessite un recalage des coupes entre elles. Il conviendra alors d'étudier différents algorithmes de recalage.
D'autre part, il conviendra de comparer cette méthode avec une méthode de recalage puis segmentation 3D.

La segmentation de ces glandes réalisée, on souhaite pouvoir effectuer des mesures automatiques de volumes, de variations de volumes, ....

L'outil construit lors du stage sera le plus ergonomique possible . Il conviendra également de penser l'architecture logicielle de facon à faciliter l'évolution de cet outil ainsi que l'intégration du premier stage. Les deux stages étant assez proches, les étudiants devront travailler en collaboration.

NOM DES RESPONSABLES : RENUMERATION :

oui pendant le stage. Rémunération selon bareme CNRS